Video: Cum sunt asamblate contigurile în schele?
2024 Autor: Miles Stephen | [email protected]. Modificat ultima dată: 2023-12-15 23:40
Când se creează o schiță a genomului, citirile individuale ale ADN-ului sunt primele asamblate in contigs , care, prin natura lor asamblare , au decalaje între ele. Următorul pas este la apoi faceți puntea dintre acestea contigs la creeaza o schelă . Acest lucru se poate face folosind fie maparea optică, fie secvențierea perechilor de perechi.
În mod similar, s-ar putea să vă întrebați, ce sunt contig-urile și schelele?
A schelă este o porțiune a secvenței genomului reconstruită din clone de pușcă din întreg genomul secvențial final. Schele sunt compuse din contigs și goluri. A contig este o lungime adiacentă a secvenței genomice în care ordinea bazelor este cunoscută la un nivel de încredere ridicat. In unele cazuri, schele se poate suprapune.
De asemenea, ce este contigs în bioinformatică? A contig (din contiguu) este un set de segmente de ADN suprapuse care împreună reprezintă o regiune de consens a ADN-ului. Contigs se poate referi astfel atât la secvența de ADN suprapusă, cât și la segmente (fragmente) fizice suprapuse conținute în clone în funcție de context.
În acest sens, cum sunt asamblate contig-urile?
Setul secvenței de ADN suprapuse a fragmentelor de ADN este cunoscut ca a contig . Contig maparea este un proces prin care se suprapun clonele asamblate pentru a ordona că se suprapun. Aceasta presupune aranjarea contigs în ordine şi orientare. Clonează contigs poate fi automat asamblate folosind secvențele lor BAC-end.
De ce sunt importante contigs?
Contig asamblarea este o important pas în asamblarea genomului. Pentru cartografiere, clonele care se suprapun sunt asamblate în secvența care se suprapun. Fiecare fragment este donat într-un vector și secvențiat de la ambele capete pentru a produce o lungime a secvenței de aproximativ 600-700 bp. Secvența de la ambele capete ale fragmentului de ADN se numește un capăt de pereche.
Recomandat:
Ce este o proteină de schele și de ce este importantă?
În biologie, proteinele de schelă sunt regulatori cruciali ai multor căi cheie de semnalizare. Deși schelele nu sunt strict definite ca funcție, se știe că ele interacționează și/sau se leagă cu mai mulți membri ai unei căi de semnalizare, legându-le în complexe
În ce mod sunt asemănătoare alunecările de teren și curgerile de noroi. Cum sunt diferite?
Gravitația provoacă mișcări de masă. Alunecările de teren, curgerile de noroi, târârile și versanții sunt agenți ai eroziunii. Alunecările de teren conțin doar rocă și sol, în timp ce fluxurile de noroi conțin rocă, sol și un procent ridicat de apă
Care sunt cele șase elemente esențiale ale geografiei așa cum sunt definite de Consiliul Național pentru Educație Geografică?
Identificați și aplicați cele șase elemente esențiale ale geografiei (adică, lumea în termeni spațiali, locuri și regiuni, sisteme fizice, sisteme umane, mediu și societate și utilizări ale geografiei), inclusiv termenii specifici pentru fiecare element
Care sunt cele patru numere cuantice pentru electroni și cum sunt ele definite?
Cele patru numere cuantice folosite pentru a descrie electronii sunt n=2, ℓ=1, m=1, 0 sau -1 și s=1/2 (electronii au spini paraleli)
Care sunt unitățile structurale care alcătuiesc compușii ionici și cum sunt denumiți?
Pentru compușii ionici binari (compuși ionici care conțin doar două tipuri de elemente), compușii sunt denumiți prin scrierea întâi a numelui cationului urmat de numele anionului. De exemplu, KCl, un compus ionic care conține ioni K+ și Cl-, este numit clorură de potasiu